Septembre 2001 , Wetlands Engineering est créée par son gérant actuel, M. Christian-Marie Bols sous le statut d'une société privée à responsabilité limitée. Son objectif est de développer des technologies innovantes et performantes liées à l'environnement.
Juillet 2003 , la société réalise une importante affaire immobilière en rachetant à Monsanto trois bâtiments du parc scientifique de Louvain-la-Neuve (6500m² de bureaux, halls et laboratoires partiellement équipés). Elle développe alors une activité immobilière qui cherche à renforcer le pôle des biotechnologies en Région wallonne. Cette opération se révèle rapidement rentable et assure à la croissance de l'entreprise une assise financière.
Une année plus tard, le projet européen SOPHIED est lancé. Il regroupe 26 partenaires universitaires et industriels autour des thématiques environnementales suivantes : le développement de nouvelles technologies de bioremédiation des effluents colorés, le développement de nouveaux enzymes à intégrer dans la production des colorants existants et le développement de nouveaux colorants moins polluants et à haute valeur ajoutée.
Wetlands Engineering, fort impliquée dans le projet, en devient SME leader.
Décembre 2006 , un nouveau projet européen QUORUM SENSING voit le jour, il cherche à comprendre le « quorum sensing » des fungi par une approche à un niveau moléculaire puis pré-industriel.
A ce jour , l'entreprise emploie plus de dix personnes et présente un chiffre d'affaires en croissance.